Configurar el fichero /$HOME/.ssh/config (Permisos 600).
Host dominio1.com IdentityFile ~/.ssh/id_rsa_dominio1 Host dominio1.com IdentityFile ~/.ssh2/id_rsa_dominio2 Host dominio1.com IdentityFile /mnt/repositorio_key/id_rsa_dominio3
Especificar en linea de comandos una llave ssh en concreto al conectar mediante SSH.
ssh -i /mnt/repositorio_key/id_rsa_XX usuario@dominio.com