Error. El servidor no da una respuesta git válida.

fatal: protocol error: bad line length character: ~3▒▒ 18.46 MiB/s
fatal: early EOF
fatal: index-pack failed

Causa habitual: Normalmente la causa es utilizar un proxy cache etre el cliente Git y el servidor, como por ejemplo nginx.

Solución habitual: Hacer la conexión directa al servidor git.

Otra solución podría ser cambiar la shell del usuario git en cliente.

usermod -s /bin/bash git